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微波炉具有波热效应。微波炉炉腔内电磁场的变化速度每秒高达24.5亿次，作用于食物的极性分子，使之来回摆动24.5亿次/秒，由水分子之间高速的轮摆摩擦运动产生高热，从而达到加热目的。
微波炉具有生物效应。微生物细胞液吸收微波的能力优于周围的其它介质，因此在微波电磁场中的细胞会迅速破裂而导致菌体细胞死亡。