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主要内容可概括为为试卷风波或匿名信事件。
日本人在鲁迅没挂科的情况下写了匿名信，说明日本人不相信中国人在没有得到答案的情况下可以通过考试，但藤野先生支持鲁迅，日本学生嫉妒或者不相信鲁迅先生，也可引申为当时日本人对中国人的鄙视和偏见，认为除非是作弊，否则不会有这样的成就。而鲁迅先生遇到这样的情况，必然委屈，愤怒！但是藤野先生的行动给与了他安慰与鼓励。因此鲁迅先生感激，怀念藤野先生。日本学生对鲁迅的民族歧视与藤野先生作对比，也侧面突出了藤野先生高尚的人格魅力。
匿名信这一事件为下文的看电影事件及弃医从文做了铺垫，另外匿名信事件中日本同学和中国人的表现刺激了鲁迅，使他明白医学只能救人的身体，救不了人的灵魂和精神，所以弃医从文。