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藤野先生一文中鲁迅弃医从文的原因是：看电影事件与匿名信事件之后鲁迅选择了弃医从文。最初在东京求学，因看不惯清国留学生的作为，于是转到仙台。
在仙台期间，他因是中国人而遭到匿名信的侮辱，后来在看电影时，影片中是日本战胜而过的情形，却有中国人给俄国人当侦探，被砍头时，围看的中国人却叫好。
为了祖国的前途和命运，毅然地放弃了跟随生平最敬爱的老师一一藤野先生学习医学，摈弃了科学救国的改良主义道路，改为从事文艺运动以唤醒人民群众起来革命；从而激励自己要永远不忘革命的初衷，决心同封建及帝国主义势力斗争到底。
鲁迅在此认识了这位日本学者，并且同他建立了深厚的师生友谊。在日本军国主义影响下，当时的日本人对中国人民抱有狭隘的民族偏见。但藤野先生并不如此，他对来自弱国的鲁迅毫不歧视，倍加爱护，并以自己的高尚品质给鲁迅以极大的影响。