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纵隔子宫对妊娠的影响因人而异。一般状况下，有纵隔子宫不容易妊娠，且妊娠后易于时有发生流产、早产及胎位异常状况。但也有部分女性直到自己正常分娩后或做剖宫产手术后才明白自己有纵隔子宫，这种纵隔子宫不需要治疗。
多数纵隔子宫病人，有可能会影响受精卵着床以及日后胚胎的发育生长。因此有纵隔子宫的病人妊娠后可通过孕酮和血HCG监测早期胚胎发育情形。在怀孕中后期需留意避免时有发生胎膜早破、流产或者早产等状况。