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有害垃圾的清理频率远低于其他垃圾，如果将一次性口罩投入有害垃圾，则有可能会导致大量一次性口罩积聚得不到及时清理，不利于卫生清洁，也会容易导致细菌转播。
一次性口罩丢弃时最理想应该归入医院医疗垃圾容器，循医疗垃圾途径处理。然而一般情况下，市民和游客周围没有医疗垃圾容器。
目前大部分丢弃的一次性口罩都可能未带有病菌，在周围没有医疗垃圾容器的情况下，将口罩投入其他垃圾，由环卫部门每天清运和处理，是目前最佳的处理办法。