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北瓜的茎粗壮，圆柱状，有白色的短刚毛，叶柄粗壮，圆柱形，长15~20厘米，叶片肾形或圆肾形，边缘有细锯齿。
北瓜是雌雄同株，雄花单生，花梗长10-20厘米，有短柔毛，花萼筒钟形，花冠边缘皱褶状，向外反折。北瓜的雌花也是单生，子房卵圆形，花柱短。
北瓜原产于南美洲的玻利维亚、智利和阿根廷等地，已经传播到世界各地，中国的北瓜可能是从印度传入。